В процедуре ПриНачалеРаботыСистемы() на рабочей станции можно вставить вызов команды NET TIME для синхронизации с сервером или другим компьютеров, выглядеть это будет примерно так:

Код 1C v 8.х

 КомандаСистемы("net time \\ИМЯ_СЕРВЕРА /set /yes");   

или запуск 1C сделать из батника и там сначала установить время с помощью NET TIME, а потом и 1с-ку стартануть.