Чтобы отобразить доход учредителя в программе 1С нужно:
1. Добавить учредителя в справочник ФизЛиц
2. Внести его доходы и налоги документом:
В Бухгалтерии:
Зарплата - Учет НДФЛ и Налогов с ФОТ - Документы учета НДФЛ и Налогов с ФОТ
Кнопка добавить и в списке документ Ввод Доходов, НДФЛ и Налогов с ФОТ
В ЗУПе :
Расчет зарплаты по организациям - Налоги и взносы - Корректировка учета НДФЛ и Страхов. Взносов

3. Далее, как обычно, формируете справку 2-НДФЛ