При обновлении УПП 1.3 с релиза 56.1 на 56.2 - конфигурация поставщика изменилась, а основная конфигурация осталась та же, обновляю эту базу давно, такого никогда не встречала, в чем может быть проблема?
так запустите обновление по новой или сравните основную конфигурацию с конфигурацией поставщика - и будет все