ВЫБРАТЬ тзПринято.ДатаДок, тзПринято.Док, тзПринято.Принято, тзПринято.СкладПолучатель ИЗ РегистрСведений.ИсторияСтатусовСправочниковИДокументов КАК ИсторияСтатусовСправочниковИДокументов ЛЕВОЕ СОЕДИНЕНИЕ (ВЫБРАТЬ ПеремещениеТоваров.Дата КАК ДатаДок, ПеремещениеТоваров.Ссылка КАК Док, ИсторияСтатусовСправочниковИДокументов.Дата КАК Принято, ПеремещениеТоваров.СкладПолучатель КАК СкладПолучатель ИЗ РегистрСведений.ИсторияСтатусовСправочниковИДокументов КАК ИсторияСтатусовСправочниковИДокументов ЛЕВОЕ СОЕДИНЕНИЕ Документ.ПеремещениеТоваров КАК ПеремещениеТоваров ПО ИсторияСтатусовСправочниковИДокументов.Объект = ПеремещениеТоваров.Ссылка И (ИсторияСтатусовСправочниковИДокументов.Статус = ЗНАЧЕНИЕ(Справочник.СтатусыСправочниковИДокументов.ПТПринято)) ГДЕ ПеремещениеТоваров.Проведен И ПеремещениеТоваров.Дата МЕЖДУнДата ИкДата И ПеремещениеТоваров.Организация =Организация) КАК тзПринято ПО ИсторияСтатусовСправочниковИДокументов.Объект = тзПринято.Док И (ИсторияСтатусовСправочниковИДокументов.Статус = ЗНАЧЕНИЕ(Справочник.СтатусыСправочниковИДокументов.ПТОтгружено))
Избавься от вложенного запроса(перенеси его во временную таблицу), а потом соедини первую часть запроса и временную таблицу. так и работать быстрее будет. А на какую строку ругается или в чем проблема?