Для этого можно воспользоваться возможностью программного доступа к серверу 1С:Предприятия 8. Нужно создать COM-коннектор и выполнить метод ConnectWorkingProcess(), который позволяет подключиться к указанному серверу.
Затем следует аутентифицироваться с правами администратора в выбранной информационной базе, получить все клиентские соединения этой базы и разорвать их. Завершение работы пользователей