Думаю, что все знают, как работает 1с с FTP сервером, но вот как работать с sFTP или FTPs сервером?
Первое что Вам нужно сделать - это установить бесплатную программу WinSCP, скачать ее Вы сможете здесь, также там есть вся необходимая литература по пользованию данной программы.
После того как Вы установили программу, Вам нужно добавить сессию, там все просто, прописываете узел, порт, логин и пароль к серверу.
Так же посоветую Вам вести логи данной программы, что бы потом можно было в любой момент посмотреть из-за чего не произошел обмен данными или проверять лог на успех или не успех синхронизации файлов. Для того что бы у Вас создавался лог нужно зайти на закладку «Журнализация» установить флажок записывать у файл и выбрать путь, имя файл советую сделать таким образом !S!Y!M!D.txt, это означает, что каждый день будет создаваться новый файл для лога с таким наименованием S – имя сессии, Y – год, M – месяц, D – день, то есть Вам потом будет намного удобнее считывать данные из логов.
Теперь приступим непосредственно к программирования в 1с и для этого нам нужно только знать основные команды WinSCP, весь список которых можно посмотреть на сайте программы. А я Вам приведу только те команды которые использовал я и которых на мой взгляд хватит для того что бы 1с успешно обменивалось данными с sFTP или FTPs серверами. Также я напишу что, зачем и в какой последовательности делал:
1. Перед тем как делать синхронизацию данных, нужно проверить есть ли вообще соединение с сервером, для этого мы делаем следующее:

Код 1C v 8.х

 ПроверимСоединение = """" +  ПутьWinSCP + """" + " /console /command " +  """option batch abort"" " + """open " + ПрофильWinSCP + """ " + " ""close"" ""exit""";

net = Новый COMОбъект("WScript.Shell");

net.Run(ПроверимСоединение, 0, Истина);   

где ПутьWinSCP – строка – путь к программе (c:\Program Files (x86)\WinSCP\WinSCP.com, ОБРАТИТЕ внимание, что расширение файла должно быть com), ПрофильWinSCP – строка – профиль сессии, то как Вы назвали Вашу сессию, к примеру test_sFTP.
2. После того как мы выполнили предыдущую команду, настоятельно рекомендую делать следующее, искать по дате лог WinSCP и проверять его, не было ли ошибки в соединении, вариантов как это сделать много, но я делал так: с конца текста искал строку «Failed», до тех пор, пока не находил «Session name: " + ПрофильWinSCP», после этого поиск прерываем, ну и собственно если была обнаружена строка «Failed», то при подключении была ошибка.
3. Делаем синхронизацию файлов:

Код 1C v 8.х

 СтрокаСинхронизация = """" +  ПутьWinSCP + """" + " /console /command " +  """option batch abort"" " + """open " + ПрофильWinSCP + """ " + """synchronize both " + КаталогНаСервере1С + " " + КаталогНаSFTPСервере  + """ " + """ close"" ""exit""";

net = Новый COMОбъект("WScript.Shell");

net.Run(СтрокаСинхронизация, 0, Истина);   

После этого снова проверяем лог.

Остальные команды которые могут Вам понадобится:
Запись файла на SFTP сервер:

Код 1C v 8.х

 СтрокаСинхронизация = """" +  ПутьWinSCP + """" + " /console /command " +  """option batch abort"" " + """open " + ПрофильWinSCP + """ " + """synchronize both " + КаталогНаСервере1С + " " + КаталогНаSFTPСервере  + """ " + """ close"" ""exit""";

net = Новый COMОбъект("WScript.Shell");

net.Run(СтрокаСинхронизация, 0, Истина);   

Скопировать файл с SFTP сервера:

Код 1C v 8.х

 СтрокаПрограммы = """" +  ПутьWinSCP + """" + " /console /command " +  """option batch abort""    " + """open " + ПрофильWinSCP + """ " + """get "  + КаталогНаSFTPСервере + "/" + ИмяФайлаСтр + " " + КаталогНаСервере1С + "\" + """ " + """close"" ""exit"";

net = Новый COMОбъект("WScript.Shell");

net.Run(СтрокаПрограммы, 0, Истина);   

Получить список файлов на SFTP серверу и записать его в файл:

Код 1C v 8.х

 СтрокаПрограммы = "cmd.exe /c """"" + ПутьWinSCP + """ /console /command " +  """option batch abort"" " + """open " + ПрофильWinSCP + """ " + """ls " + КаталогНаSFTPСервере + """""" + """ " + """ close""" + " > FMfiles.txt 2>&1" + """ " + """ exit""";

ЗапуститьПриложение(СтрокаПрограммы, ПутьКЛогам, Истина, КодВозврата);   

Источник: www.odincplus.com

Обычно ошибка возникает когда в процессе сохранения конфигурации, был сбой. В результате Конфигурация сохранилась не корректно.
1. Попробовать проверить через тестирование и исправление или ChDBFl.exe
2. Посмотрите следующие варианты решения проблемы:

В некоторых случаях помогает полная очистка КЭША, В ОС Windows 7 находиться C:\Users\Администратор\AppData\Roaming\1C\1Cv82 и C:\Users\Администратор\AppData\Local\1C\1Cv82 (Win7x64).

или подробнее:
1. Необходима чистая конфигурация той же версии - рабочая.
2. Очиста кеша полная (указано выше).
3. Запускаем чистую базу в режиме конфигуратора и открываем конфигурацию. При этом 1С создает ее кеш в C:\Users\Администратор\AppData\Local\1C\1Cv82 (набор файлов и папок в папке с ID конфигурации.) так же нам нужен кеш C:\Users\Администратор\AppData\Roaming\1C\1Cv82. Можно просто переименовать данные папки после закрытия 1С.
4. Запускаем наш не рабочую базу в режиме конфигуратора и смотрим кеш. И в результате имеем две папки с ID конфигурации (Живой и Мертвой).
5. Закрываем все и подменяем кеш мертвой конфы на живую полностью. Т.е. удаляем текущую и заменяем ранее переименованной папкой.
6. Запускаем не рабочую базу в режиме конфигуратора И ВОТ первый успех - дерево конфигурации открыто, разделы меню управления конфигурацией активны.
7. Идем в управление поддержкой, и снимаем с поддержки полностью. сохраняем, обновляем. Можно обновить через файл конфигурацией рабочей базы.
8. Удалем кеш полностью.
9. Запускаем не рабочую базу в режиме конфигуратора, пытаемся открыть конфигурацию - все открывается, ошибки нет.
10. Запускаем 1С. Все доступно. Данные на месте.

---

Было такое же сообщение когда динамически обновил конфигурацию центральной базы и сделал обмен на переферийной и на переферийной появилось подобное сообщение.
1. Т.к. в конфигуратор на переферийной вообще не пускался, то пришлось удалить папку C:\Documents and Settings\Admin\Application Data\1C\1Cv81.
2. Зашел в конфигуратор и выбрал Конфигурация - Конфигурация базы данные - Вернуться к конфигурации БД.
3. ГлавныйУзел установил неопределено.
4. Конфигурация - Загрузить конфигурацию из файла (центральная конфигурация).
5. ГлавныйУзел установил необходимый.

---

У меня возникла похожая ситуация, но на 8.1. При динамическом обновлении конфигурации видимо произошел сбой, после чего попытка выгрузить и как Основную конфу и конфу БД при дальнейшей попытке загрузить файл в локальную базу вываливалось "нарушена целостность структуры конфигурации". Но БД работоспособна. Ни тестирование и исправление ни ChDBFl.exe ничего не дали.

Селал бекап рабочей базы и загрузил его в чистую базу. Добавил план обмена
http://kb.mista.ru/article.php?id=7
и создал Начальный образ. В БД образа конфигурация исправилась.

Если не поможет могу посоветовать вариант к которому хотел прибегнуть сам:
1. найти ближайший релиз конфигурации, загрузить его в чистую БД (восстанавливаемую).
2. создать совершенно чистую БД (промежуточную)
3. открыть конфигуратор испорченной БД.
4. скопипастить модули и объекты, в которых происходили изменения с последнего релиза (в моем случае намного проще, поскольку изменения происходили только в модулях и формах, структура данных осталась прежней а все изменения документируются постерами) из испорченной БД в промежуточную.
5. Выгрузить промежуточную конфигурацию.
6. Объеденить ее с восстанавливаемой БД.
7. Выгрузить восстанавливаемую конфигурацию в файл.
8. Загрузить в испорченную БД конфигурацию из восстанавливаемой.

По идее должно получиться максимальное приближение к рабочей базе, но работка конечно не из легких. Но лучше все-таки чем потерять всю базу.

---

Еще один вариант решения проблемы, связанной с повреждением конфигурации поставщика. При обновлении конфигурации, находящейся на поддержке с возможностью редактирования и нарушенной целостностью конфигурации поставщика, может вылетать сообщение:

Мой вариант решения - заменить конфигурацию поставщика нашей базы.
Последовательность действий следующая:
1. Удалить конфигурацию поставщика путём снятия с поддержки(Конфигурация->Поддержка->Настройка поддержки->Снять с поддержки)
2. Создаем файл поставки конфигурации(Конфигурация->Поставка конфигурации->Создать файлы поставки и обновления конфигурации). Файл при этом назовем work файл поставки.cf
3. Объединяем нашу конфигурацию с только что созданным файлом поставки(Конфигурация->Сравнить, объединить с конфигурацией из файла). При этом появится предложение вновь поставить конфигурацию на поддержку
В появившемся окне сравнения конфигураций нажимаем "Выполнить",
4. Обновляем конфигурацию базы данных(Конфигурация->Обновить конфигурацию базы данных).
Поидее, выполняя данные действия, мы реструктуризовали конфигурацию поставщика.
Теперь можно попробовать обновить нашу конфигурацию до следующей версии в обычном режиме.