При программной работе с Word или Excel могут возникнуть ситуации, когда в процессах остается висеть открытый процесс:
- WORD.EXE
- EXCEL.EXE
Завершение процесса через Word.Quit() или Excel.Quit() не срабатывает.
Эта проблема тянется еще со старых версии и появляется в случаях, когда обращение к Word или Excel происходит не в интерактивном режиме. Например, при запуске обработок через назначенные задания Windows.

Данную проблему можно решить принудительно завершив процее командой:
taskkill /F /IM word.exe
taskkill /F /IM excel.exe

Для использования в коде 1С:

Код 1C v 8.х

 КомандаСистемы("taskkill /F /IM word.exe");

КомандаСистемы("taskkill /F /IM excel.exe");