Для того чтобы при расчете Заработной платы учитывался новый дополнительный отпуск, необходимо для начисления (например Оклад по дням и т.д) настроить вытеснение, добавив этот новый Дополнительный отпуск.

После этого ЗУП начинает понимать дополнительный отпуск